Nhằm đáp ứng hầu hết các lượt khách du lịch Malaysia hàng năm, các hãng hàng không luôn có những đường bay thẳng từ Việt Nam đến sân bay Kuala Lumpur, khởi hành từ Hà Nội, Thành phố HỒ chí Minh.
Nếu tính đường bay từ HÀ Nội - Kuala Lumpur bạn có thể lựa chọn các hãng hàng không nội địa như Vietnam Airlines hay hãng hàng không quốc tế Malaysia Airlines hay Air Asia. Giờ bay của Vietnam Airlines từ hà Nội thường xuất phát từ khoảng 14h55-19h00 hàng ngày (theo giờ địa phương), còn giờ bay về thường vào khoảng 19h10-21h15. Có lẽ vì chưa có hãng hàng không nội địa nào khai thác đường bay Hà Nội/Hồ Chí Minh đi Kuala Lumpur nên vé đi du lịch Malaysia của Vietnam Airlines khá cao.
Malaysia Airlines là hàng không quốc gia của Malaysia, giờ bay từ Hà Nội-Kuala Lumpur của hãng này cũng không thuận tiên nếu du lịch Malaysia bởi giờ xuất phát của chuyến bay đi là khoảng thời gian chiều 13h20 - 17h45 còn giờ về thì lại khá sớm, buổi sáng 9h50 - 12h15. Tính ra thì khá mất thời gian. Cũng tương tự như Vietnam Airlines, giá vé của hãng hàng không này cũng phải rơi vào khoảng 300USD, cũng không phải rẻ nếu du lịch Malaysia tiết kiệm.
Air Asia là hàng không đươc nhiều du khách du lịch Malaysia lựa chọn bởi giá vé bán chặng Hà Nội Kuala Lumpur được xem là rẻ nhất tính đến thời điểm hiện nay, với mức giá khoảng 140$ và giờ bay cũng khá hợp lí để du khách có thể lựa chọn đi sáng về chiều tối, thời gian vui chơi du lịch Malaysia cũng được thoải mái và nhiều hơn.
Sân bay Quốc tế Kuala Lumpur (KUL) cách thủ đô Kuala Lumpur-Malaysia khoảng 50km, và chia thành 2 khu vực riêng biệt, phục vụ cho 2 hãng bay khác nhau. Nếu như khu thứ nhất là khu nhà ga cao cấp, được đặt mặc đinh là Kuala Lumpur International Airport (KLIA) thì khu thứ hai là Low-Cost Carrier Terminal (LCCT) lại chủ yếu phục vụ cho cho các hãng hàng không giá rẻ như: Tiger Airways, Air Asia, Cebu Air. Các hãng hàng không quốc gia thường sẽ hạ cánh tại KLIA như Vietnam Airlines, Malaysia Airlines, Jetstar Pacific.
Không giống như nhà ga Nội bài Việt Nam có sân bay quốc tế và nội địa với khoảng cách giữa 2 nhà ga là 2 cây là có xe bus để di chuyển ở nhà ga thì tại Malaysia, khoảng cách giữa hai khu sân bay này khoảng ~04km, nên nếu đi bộ thì cũng khá xa, nhất là không tiện lợi nếu bạn du lịch Malaysia với rất nhiều hành lý.
Tương tự như hải quan Singapore, hải quan Malaysia ở quầy tại sân bay KUL hay PEN đều khá nghiêm ngặt. Nếu du lịch Malaysia là cả 1 nhóm nữ cũng sẽ bị hỏi, mà cả nhóm nữ chỉ có một vài bạn nam cũng dễ bị hỏi kiểu như sang Malaysia làm gì, đi bao lâu, ở đâu,... bởi hiện nay, tình trạng buôn người cũng như mại dâm xảy ra khá nhiều.