1. Quần thể kiến trúc Phật giáo Horyuji
Quần thể kiến trúc Phật giáo Horyuji là quốc bảo của du lịch Nhật Bản nằm ở tỉnh Nara, được UNESCO công nhận là di sản thế giới năm 2003. Trong đó, đáng chú ý nhất là chùa Horyuji (Pháp Long học vấn tự)với một số tòa kiến trúc bằng gỗ cổ của thế giới, hay chùa Hokkiji với tượng Bồ Tát Quán Thế Âm có 11 mặt.
2. Lâu đài Himeji
Lâu đài Himeji là một trong những điểm đến không thể bỏ qua khi du lịch Nhật Bản. Lâu đài nằm ở thành phố Himeji thuộc tỉnh Hyogo, là một khối kiến trúc lâu đài được cải tạo thời xưa từ một pháo đài. Lâu đài Himeji được xem là hình mẫu kiến trúc lâu đài còn hoàn toàn vẹn nguyên qua các đợt ném bom trong Chiến trang thế giới thứ II và động đất Kobe của Nhật Bản.
3. Đảo Yakushima
Với hơn 300.000 lượt khách du lịch Nhật Bản yêu thiên nhiên viếng thăm hòn đảo này mỗi nă, hòn đảo Đảo Yakushima không hổ là di tích thắng cảnh của nhật Bản. Hòn đảo nằm thuộc địa phận tỉnh Kagoshimam nhưng một thảm thực động vật phong phú và là di sản thiên nhiên thế giới được UNESCO công nhận.
4. Cụm di tích cổ đô Kyoto
Các điểm đến thuộc cụm di tích cổ đô Kyoto điểm đến không thể bỏ qua với bất kì hành trình du lịch Nhật Bản nào. Tại đây, bạn sẽ được khám phá hệ thống 14 chùa Phật giáo bao gồm chùa Kyogokoku-ji, chùa Kiyomizu-dera, chùa Enryaku, chùa Daigo, chùa Ninna, thiền viện Byodo-in, chùa Kozan, chùa rêu Saiho, chùa Tenryu, chùa Rokuon, chùa Jisho, chùa Ryoan, chùa Nishi Hongan; và 3 đền Thần đạo bao gồm đền Ujigami, đền Kamigamo, đền Shimogamo,1 lâu đài cổ Nijo. Nổi bật trong số đó là chùa Kiyomizu với kiến trúc bằng gỗ trên cao, chùa Kinkakuji được bao phủ bằng những chiếc lá bằng vàng nguyên chất, chùa Ryoanji với khu vườn đá phong cách thiền, và chùa Kozanji nằm sâu trong rừng với những quốc bảo quý nhất của Nhật.
5. Làng lịch sử Shirakawa-go và Gokayama
Hai ngôi làng Shirakawa-go và Gokayama nằm ở khu vực giáp ranh hai tỉnh Gifu và Toyama của Nhật. Hai ngôi làng này dù nằm ở làng quê với đồng ruộng yên bình, nhưng lại có kiến trúc nhà độc đáo với hai mái tranh tạo thành hình như bàn tay đang chắp lại cầu nguyện. Mặc dù hàng năm tuyết rơi ở đây khá nhiều nhưng các tòa nhà khá vững chãi và có thể chịu được sức nặng của tuyết đóng vào mùa đông.
6. Khu tưởng niệm hòa bình Hiroshima – Genbaku Dome
Đây là nơi từng chịu ảnh hưởng nặng nề của quả bom nguyên tử, và hiện nay đã trở thành một điểm du lịch phổ biến của du lịch Nhật Bản. Trong số đó phải kể đến khu tưởng niệm hòa bình Hiroshima với vòm bom nguyên tử Genbaku Dome - nơi còn sót lại kiến trúc duy nhất trong khu vực gần địa điểm phát nổ của quả bom.
7. Đền Itsukushima
Đền Itsukushima là công trình thần đạo quan trọng của du lịch Nhật Bản - nằm ở đảo Miyajima thuộc tỉnh Hiroshima - nổi tiếng với cánh cổng torii khổng lồ. Cánh cổng torii này ngập trong nước biển phía trước núi Misen của đảo Miyajima chính là một trong 3 cảnh đẹp nhất của Nhật Bản mà du khách nào đến đây cũng phải trầm trồ khen ngợi.